分析保护柱是液相色谱分析中重要的色谱耗材，使用保护柱可大大降低分析柱受污染的程度，延长分析柱使用寿命。
保护柱位于进样器与分析柱之间，作用主要两方面：
1.截留不溶性颗粒
2.吸附样品基质中的杂质
以下几种情况建议使用保护柱：
1.中药、天然产物及合成中间体等基质较复杂的样品分析——因溶解性差异导致样品析出而污染分析柱的情况比较严重，梯度洗脱时影响更大。
2.生物样品分析——因样品的不可逆吸附导致的污染，保护柱可先于分析柱承受这种污染，从而延长分析柱寿命。
保护柱很重要，但选择合适的保护柱更重要，选择或使用不当也可能带来截然相反的效果。
分析保护柱分类及选择：
从材质上分：不锈钢材质和PEEK（聚醚醚酮）材质
PEEK材质优缺点——样品对金属离子比较敏感时，选择PEEK材质比较合适，比如某些蛋白分析会用到PEEK材质的分析柱，主要就是考虑到这方面的因素；
不锈钢材质优缺点——大部分小分子化合物的分析，选择不锈钢材质保护柱居多，特别是当流动相体系使用到四氢呋喃（THF）或DMSO等一些溶解性较强的溶剂时，必须选择不锈钢材质，甚至对于HPLC系统的管路也需要替换成不锈钢材质，因THF对于PEEK管路有相当强的腐蚀作用。
从结构上分：卡套式（柱芯+柱套）和直接填装短柱
直接填装短柱优缺点——这种结构的保护柱实质就是短的色谱柱，一般填装的填料跟分析柱填料*一样。生物样品分析中，用这种类型保护柱居多，除可过滤一些不溶颗粒外，还可除去一些在分析柱上易吸附的杂质。缺点是，一次性使用，污染严重时，只能报废。
卡套式保护柱优缺点——卡套式保护柱的柱套可反复使用，柱芯污染后可替换，厂家会提供配套的保护柱芯，但购买时需要注意，柱芯中有与分析柱匹配的填料，需要确认柱芯中的填料类型再购买。同时，柱芯和柱套需是来源于同一厂家的同一规格，否则，会存在匹配上的差异，导致峰型异常或者漏液。
从连接方式上分：独立式和直连式
独立式分析保护柱优缺点——保护柱和分析柱之间用一段管路连接，不用担心与分析柱在连接上的匹配问题。但使用管路连接时，连接不当容易产生死体积。
直连式保护柱优缺点——保护柱接口带螺纹，可直接与分析柱连接，死体积小，UPLC分析时建议选择直连式保护柱；缺点：购买时需保证接口与分析柱匹配。
让色谱分离更有效
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